Magento cung cấp 2 phiên bản riêng biệt: Magento Open Source (tên cũ là Magento Community Edition - phiên bản cộng đồng) và Magento Commerce (phiên bản doanh nghiệp); Magento Commerce lại chia làm 2 phiên bản: on-premises (tên cũ là Magento Enterprise Edition) và platform-as-a-service (tên cũ là Magento Enterprise Cloud Edition). Ngoài ra còn có 2 phiên bản cũ khác đã ngừng hoạt động là Magento Professional Edition và Magento Go.

Magento Open Source

Magento Open Source, trước đây là Magento Community Edition, là một nền tảng Thương mại điện tử Mã nguồn mở. Nhà phát triển có thể bổ sung các tệp lõi và mở rộng chức năng bằng cách thêm các module cắm-chạy cung cấp bởi các nhà phát triển khác. Từ phiên bản beta đầu tiên phát hành năm 2007, Magento Open Source đã được phát triển và tùy biến để cung cấp một nền tảng Thương mại điện tử với các chức năng cơ bản.

Magento Commerce

Phát hành ngày 11/04/2016, Magento Commerce là một nền tảng-như-một-dịch vụ Thương mại điện tử.

Magento 2 has many new and improved features, developer tools, and its architecture is quite different from all the previous versions.

Magento 2 có nhiều tính năng được cải thiện và tính năng mới, các công cụ phát triển, và cấu trúc của nó hoàn toàn khác với tất cả các phiên bản trước.[11]

Magento Commerce (On-Premises)

Magento Commerce (On-Premises), trước đây là "Magento Enterprise Edition" được phát triển từ Magento Open Source và dùng chung các tập tin cốt lõi.